Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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NR1I3Q14994 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1I3Q14994 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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NR1I3Q14994 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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NR1I3Q14994 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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NR1I3Q14994 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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NR1I3Q14994 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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NR1I3Q14994 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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NR1I3Q14994 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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