Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
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