Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQLEQ14534 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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