Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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