Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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