Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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