| RUNX2 | Q13950 | FAR1-204 | ENST00000532502 | 5820 nt | TSL 2 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007336.1-201 | ENST00000576365 | 3828 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AGL-204 | ENST00000370161 | 6923 nt | TSL 5 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR340-201 | ENST00000362125 | 95 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-62P-201 | ENST00000362599 | 164 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.39-201 | ENST00000362620 | 98 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | XGY1-201 | ENST00000381172 | 446 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1145P-201 | ENST00000384246 | 107 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010095.1-201 | ENST00000443543 | 144 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IFNA11P-201 | ENST00000446352 | 526 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353148.1-201 | ENST00000449761 | 463 nt | TSL 2 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590422.1-201 | ENST00000451829 | 364 nt | TSL 3 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-14P-201 | ENST00000459331 | 62 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093259.1-201 | ENST00000509755 | 300 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR2355-201 | ENST00000517199 | 87 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021269.2-201 | ENST00000532318 | 330 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AK6P2-201 | ENST00000549020 | 471 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CR936218.1-201 | ENST00000570454 | 304 nt | TSL 2 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026271.5-201 | ENST00000577873 | 130 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01206-214 | ENST00000610910 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010999.1-201 | ENST00000611856 | 324 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC083806.3-201 | ENST00000614016 | 455 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008873.1-201 | ENST00000625051 | 138 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1291-201 | ENST00000627649 | 87 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091812.1-201 | ENST00000432235 | 1948 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DDIAS-201 | ENST00000329143 | 3367 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZCCHC10-202 | ENST00000355372 | 2160 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRKACB-204 | ENST00000370685 | 4481 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OGN-201 | ENST00000262551 | 2971 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP289-201 | ENST00000362332 | 137 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-545P-201 | ENST00000362681 | 104 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA3A-201 | ENST00000364113 | 130 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-879P-201 | ENST00000364328 | 108 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA67.1-201 | ENST00000364749 | 141 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.332-201 | ENST00000365271 | 113 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEFA7P-201 | ENST00000382676 | 285 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-793P-201 | ENST00000384233 | 104 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY3P4-201 | ENST00000384428 | 101 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NPS-201 | ENST00000398023 | 270 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1262-201 | ENST00000408276 | 93 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590399.1-203 | ENST00000412631 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL137159.1-201 | ENST00000452808 | 512 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005703.2-201 | ENST00000453339 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016925.1-201 | ENST00000458303 | 298 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL636P-201 | ENST00000497504 | 294 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SRP72-202 | ENST00000504757 | 745 nt | TSL 2 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CFAP100-207 | ENST00000510833 | 481 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-475P-201 | ENST00000516073 | 104 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA40.14-201 | ENST00000516543 | 86 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP490-201 | ENST00000517141 | 136 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANP32BP3-201 | ENST00000559213 | 706 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009127.3-201 | ENST00000570531 | 403 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3126-201 | ENST00000577443 | 74 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104984.5-201 | ENST00000586878 | 94 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022432.1-201 | ENST00000595739 | 310 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103810.6-201 | ENST00000606708 | 136 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC067747.1-201 | ENST00000608026 | 250 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4P1-201 | ENST00000457501 | 1466 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005592.1-201 | ENST00000566527 | 1640 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RICTOR-202 | ENST00000357387 | 9543 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-727P-201 | ENST00000363592 | 107 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD31B-201 | ENST00000364977 | 69 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.415-201 | ENST00000384012 | 112 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA40.19-201 | ENST00000390846 | 128 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPL42P3-201 | ENST00000401492 | 326 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR320B2-201 | ENST00000408479 | 138 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007395.1-201 | ENST00000451333 | 677 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P9-201 | ENST00000476875 | 229 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010469.2-201 | ENST00000496412 | 480 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC234781.5-201 | ENST00000508429 | 271 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA25.10-201 | ENST00000515926 | 124 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP49-201 | ENST00000516675 | 260 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1137P-201 | ENST00000517073 | 99 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-988P-201 | ENST00000519081 | 107 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GNAI2P1-201 | ENST00000541815 | 315 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RRN3P3-201 | ENST00000549207 | 578 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3124-201 | ENST00000582636 | 67 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104695.3-201 | ENST00000604052 | 296 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099654.10-201 | ENST00000640395 | 161 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BCL2L11-225 | ENST00000640419 | 249 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P35-201 | ENST00000557537 | 1720 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATF1-201 | ENST00000262053 | 2181 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VPS13A-206 | ENST00000376646 | 2262 nt | TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KTN1-214 | ENST00000554507 | 2057 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6073-201 | ENST00000352083 | 89 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.179-201 | ENST00000363844 | 90 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD87-201 | ENST00000364849 | 89 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-51P-201 | ENST00000365345 | 176 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA33.2-201 | ENST00000365413 | 134 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL357139.1-201 | ENST00000407792 | 426 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FO680682.1-201 | ENST00000421261 | 345 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OOSP1P1-201 | ENST00000423265 | 274 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353743.2-202 | ENST00000439544 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRBV12-1-201 | ENST00000479785 | 344 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LNX1-AS1-202 | ENST00000510785 | 550 nt | TSL 2 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.683-201 | ENST00000516508 | 93 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.11-201 | ENST00000516528 | 139 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003465.1-201 | ENST00000520575 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC126177.2-201 | ENST00000552154 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016925.2-201 | ENST00000605108 | 242 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |