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| RUNX3 | Q13761 | AL445305.1-201 | ENST00000432577 | 575 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL132875.2-201 | ENST00000436418 | 325 nt | TSL 5 BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2V1P7-201 | ENST00000446395 | 340 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TOMM22P6-201 | ENST00000465035 | 409 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC145146.1-201 | ENST00000496370 | 254 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105758.1-201 | ENST00000506038 | 399 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | ZNF260-203 | ENST00000588993 | 4174 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-661P-201 | ENST00000362409 | 107 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-474P-201 | ENST00000384243 | 107 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.524-201 | ENST00000384564 | 100 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.561-201 | ENST00000384694 | 100 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-308P-201 | ENST00000390957 | 107 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA12.2-201 | ENST00000391040 | 156 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU2-48P-201 | ENST00000410694 | 191 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02559-201 | ENST00000420391 | 188 nt | TSL 2 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WARS2P1-201 | ENST00000429678 | 537 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHEK2P4-201 | ENST00000450340 | 246 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPAG11B-206 | ENST00000458665 | 444 nt | TSL 5 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.639-201 | ENST00000458981 | 102 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02501-201 | ENST00000510420 | 426 nt | TSL 2 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096721.1-201 | ENST00000513540 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-699P-201 | ENST00000517081 | 110 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157688.1-201 | ENST00000555990 | 369 nt | TSL 3 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012435.2-201 | ENST00000562869 | 361 nt | TSL 3 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYP4A27P-201 | ENST00000567218 | 190 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3923-201 | ENST00000579521 | 83 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD14A-201 | ENST00000606526 | 91 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCGEM1.1-201 | ENST00000613431 | 131 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPRQ-208 | ENST00000614701 | 8289 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CSNK1G3-202 | ENST00000360683 | 4047 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RMDN2-203 | ENST00000402091 | 1973 nt | TSL 2 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND5P10-201 | ENST00000603719 | 1809 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.216-201 | ENST00000364205 | 93 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-56P-201 | ENST00000364700 | 142 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR32-201 | ENST00000384965 | 70 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ49-201 | ENST00000390488 | 56 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR208B-201 | ENST00000401172 | 77 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-62P-201 | ENST00000410125 | 130 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.597-201 | ENST00000410463 | 100 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-40P-201 | ENST00000410833 | 196 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP247-201 | ENST00000411181 | 105 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS20P15-201 | ENST00000412792 | 311 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND1P14-201 | ENST00000427400 | 950 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP50-201 | ENST00000434149 | 455 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591504.1-201 | ENST00000450681 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005703.2-201 | ENST00000453339 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U8.22-201 | ENST00000459141 | 133 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.701-201 | ENST00000516812 | 110 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590705.4-201 | ENST00000532209 | 134 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP26-201 | ENST00000534107 | 320 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084816.1-207 | ENST00000538317 | 584 nt | TSL 4 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027288.2-201 | ENST00000553028 | 243 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087463.2-201 | ENST00000565943 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016727.2-201 | ENST00000603988 | 621 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | uc_338.22-201 | ENST00000622722 | 187 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.146-201 | ENST00000363549 | 102 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA3A-201 | ENST00000364113 | 130 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-9P-201 | ENST00000364951 | 139 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.395-201 | ENST00000383945 | 109 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-17P-201 | ENST00000384245 | 107 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-18P-201 | ENST00000384527 | 107 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR561-201 | ENST00000385216 | 97 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004866.1-201 | ENST00000411748 | 78 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P42-201 | ENST00000413485 | 326 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLCL2-AS1-201 | ENST00000414844 | 311 nt | TSL 2 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01344-201 | ENST00000420760 | 261 nt | TSL 3 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4P28-201 | ENST00000426217 | 387 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CBX3P6-201 | ENST00000430257 | 527 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356124.2-201 | ENST00000442449 | 391 nt | TSL 5 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2AQ1P-201 | ENST00000451972 | 200 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU13.30-201 | ENST00000458951 | 104 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068781.1-201 | ENST00000488231 | 618 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02064-201 | ENST00000506492 | 470 nt | TSL 5 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02233-201 | ENST00000513718 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108037.1-201 | ENST00000514103 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR449C-201 | ENST00000516047 | 92 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |