Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms