Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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CUL3Q13618 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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CUL3Q13618 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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CUL3Q13618 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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CUL3Q13618 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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CUL3Q13618 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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CUL3Q13618 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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