Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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