Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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