Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
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