Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
AP3B2Q13367 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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