Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms