Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIN2BQ13224 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms