Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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