Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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NPRL3Q12980 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NPRL3Q12980 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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NPRL3Q12980 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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NPRL3Q12980 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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NPRL3Q12980 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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NPRL3Q12980 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPRL3Q12980 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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