Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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