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| FOXF2 | Q12947 | RNA5SP38-201 | ENST00000410750 | 119 nt | BASIC | 2.68 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-1199P-201 | ENST00000411249 | 104 nt | BASIC | 2.68 | □□□□□ -1.98 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC099654.7-201 | ENST00000635788 | 2127 nt | BASIC | 2.68 | □□□□□ -1.98 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AL021368.2-201 | ENST00000606125 | 5352 nt | BASIC | 2.68 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ABCG2-204 | ENST00000515655 | 4276 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.68 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | NBEAL1-203 | ENST00000449802 | 10938 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | DST-204 | ENST00000361203 | 22431 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZNF479-202 | ENST00000331162 | 2072 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SOCS4-201 | ENST00000339298 | 6667 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | TTC6-201 | ENST00000267368 | 1681 nt | TSL 5 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC073325.2-201 | ENST00000339545 | 159 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | Y_RNA.40-201 | ENST00000362645 | 93 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | RNU6-151P-201 | ENST00000364158 | 107 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC005840.1-201 | ENST00000498412 | 377 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNA5SP217-201 | ENST00000515959 | 91 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU5F-2P-201 | ENST00000516066 | 82 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR7106-201 | ENST00000612419 | 65 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC006111.3-201 | ENST00000622137 | 383 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | DLD-214 | ENST00000639772 | 421 nt | TSL 5 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ANKAR-201 | ENST00000313581 | 4391 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | IL6ST-205 | ENST00000381294 | 2574 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC100821.1-201 | ENST00000523153 | 2479 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | DOPEY1-203 | ENST00000369739 | 7743 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | HDX-201 | ENST00000297977 | 6200 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | PKHD1L1-201 | ENST00000378402 | 13076 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | VNN1-201 | ENST00000367928 | 3106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RASSF8-210 | ENST00000541490 | 5505 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | C6orf10-202 | ENST00000375015 | 2173 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ANKRD30BP1-201 | ENST00000451052 | 2186 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | TECRL-202 | ENST00000507440 | 2876 nt | TSL 5 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CYLC2-202 | ENST00000487798 | 2053 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | Y_RNA.121-201 | ENST00000363309 | 113 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-529P-201 | ENST00000363383 | 104 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-818P-201 | ENST00000364837 | 108 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | Y_RNA.510-201 | ENST00000384511 | 114 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR208B-201 | ENST00000401172 | 77 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | HIST1H2APS3-201 | ENST00000403259 | 134 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AL139132.1-201 | ENST00000431587 | 344 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SMG7-AS1-202 | ENST00000432837 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RPS12P18-201 | ENST00000442381 | 270 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC091179.3-201 | ENST00000474761 | 144 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RN7SL20P-201 | ENST00000488827 | 297 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | RNA5SP272-201 | ENST00000516095 | 111 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR3684-201 | ENST00000579779 | 74 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | Y_RNA.778-201 | ENST00000620203 | 90 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC007318.2-201 | ENST00000620999 | 243 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZEB2_AS1_1.1-201 | ENST00000621504 | 128 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC103988.1-201 | ENST00000566382 | 2177 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RICTOR-201 | ENST00000296782 | 7505 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC002543.1-201 | ENST00000299783 | 1954 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZMYM1-210 | ENST00000611874 | 4466 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | KIAA1524-206 | ENST00000491772 | 3877 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| FOXF2 | Q12947 | VSTM2A-OT1-201 | ENST00000456049 | 3031 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC010889.1-201 | ENST00000566193 | 2666 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-727P-201 | ENST00000363592 | 107 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-257P-201 | ENST00000410238 | 98 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNA5SP475-201 | ENST00000410568 | 110 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | Y_RNA.629-201 | ENST00000411368 | 105 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RPL32P35-201 | ENST00000415214 | 394 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC009963.1-201 | ENST00000417265 | 157 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | TRIAP1P1-201 | ENST00000427062 | 225 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RPS20P10-201 | ENST00000451209 | 253 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| FOXF2 | Q12947 | IFT74-AS1-201 | ENST00000456198 | 405 nt | TSL 2 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |