Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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