Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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GTF3C1Q12789 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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GTF3C1Q12789 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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GTF3C1Q12789 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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GTF3C1Q12789 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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