Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms