Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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PGGT1BP53609 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PGGT1BP53609 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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PGGT1BP53609 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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PGGT1BP53609 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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PGGT1BP53609 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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PGGT1BP53609 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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PGGT1BP53609 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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PGGT1BP53609 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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