Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPREP23469 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPREP23469 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPREP23469 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPREP23469 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPREP23469 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPREP23469 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPREP23469 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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