Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRCP08575 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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PTPRCP08575 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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