Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
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