Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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