Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms