Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
HECW1Q76N89 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HECW1Q76N89 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.9 ms