Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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