Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
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