Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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