Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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