Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CNGA3Q16281 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CNGA3Q16281 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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