Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BRD3Q15059 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms