Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
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