Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
ODF1Q14990 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ODF1Q14990 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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