Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SSPNQ14714 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms