Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQLEQ14534 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQLEQ14534 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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