Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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