Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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