Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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CKAP5Q14008 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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