Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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