Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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