Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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