Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IKZF1Q13422 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms