Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NME3Q13232 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NME3Q13232 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NME3Q13232 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NME3Q13232 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms