Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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