Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RESTQ13127 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RESTQ13127 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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RESTQ13127 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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RESTQ13127 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RESTQ13127 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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RESTQ13127 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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RESTQ13127 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RESTQ13127 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RESTQ13127 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RESTQ13127 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RESTQ13127 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RESTQ13127 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RESTQ13127 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RESTQ13127 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RESTQ13127 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RESTQ13127 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RESTQ13127 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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