Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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CHAF1BQ13112 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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CHAF1BQ13112 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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CHAF1BQ13112 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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CHAF1BQ13112 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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