Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GPS1Q13098 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GPS1Q13098 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GPS1Q13098 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GPS1Q13098 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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